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Mohsen Nady Statistics with R for Microbiome Analysis (Relié)

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Détails de l’annonce

Titre: Statistics with R for Microbiome Analysis
Condition: Neuf
Sous titres: From Raw Reads to Relative Abundance
Auteur: Mohsen Nady
Format: Relié
EAN: 9781774699027
ISBN: 9781774699027
Publisher: Arcler Education Inc
Genre: Science Nature & Math
Date de publication: 2024-03-31
Description: This book covers the necessary analysis steps for dealing with microbiome data. The microbial samples are sequenced into raw reads or fastq files. These raw reads should be quality checked to assure their quality per base or per read. Then, after removing the errors, we can infer their exact amplicon sequence variants (ASVs). After that, we taxonomically classify these sequences to represent the different taxonomy levels of species, genus, family, order, class, and phylum and generate a phylogenetic tree. Finally, the sequence data, the taxonomy table, phylogenetic tree, and sample data are combined in a single phyloseq object for ease of plotting, manipulation, and analysis of the different components of microbiome data. The final phyloseq object can also be cleaned for certain low prevalent sequences. All these steps are explained in R codes using a freely available microbiome data of 360 fecal samples.
Sujet: Anglais
Pays/Région de fabrication: CA
Item Height: 229
Item Length: 152.00
Poids: 272g
Année de publication: 2024

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  • Condition: Neuf
  • Title: Statistics with R for Microbiome Analysis
  • Titre: Statistics with R for Microbiome Analysis
  • Sous titres: From Raw Reads to Relative Abundance
  • Auteur: Mohsen Nady
  • Format: Relié
  • EAN: 9781774699027
  • ISBN: 9781774699027
  • Publisher: Arcler Education Inc
  • Genre: Science Nature & Math
  • Année de publication: 2024
  • Date de publication: 2024-03-31
  • Sujet: Anglais
  • Pays/Région de fabrication: CA
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  • Item Length: 152.00
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